1.與法人協商，以股權轉讓代替注銷。

法人因為想繼續經營公司，不愿意配合注銷，可以在符合法律和內部管理制度的情況下，將擬注銷企業的股權轉讓給法定代表人。這樣就可以免去后續的清算和注銷手續，省時省力。

2.作為債權人申請破產。

是破產公司注銷的主要條件之一。如果法人不配合，可以作為債權人向法院提出破產申請，然后進入破產清算程序。清算結束后，予以注銷。

3.與行政部門溝通解決問題。

要解鈴還須系鈴人。既然目的是辦理工商變更注銷登記，可以嘗試與行政部門溝通，在符合基本原則的基礎上，就具體手續辦理中遇到的實際困難尋求幫助。

4.股東大會決定解散。

股東大會只有三分之二的股東才能召開，其中三分之二不是股東人數，而是股份比例。

5.強制取消

對于強制注銷程序，無論法人不配合還是無法取得聯系，都可以強制注銷。

二、公司不及時注銷的后果

如果是因為法人股東不配合或者聯系不上不注銷，可能會產生以下后果：

1.公司營業執照被吊銷了，注銷比以前麻煩；

2.股東、法人進入工商局黑名單，三年內不能再次辦理營業執照；

3.稅收罰款與日俱增；

4.影響所有高管的養老金和子女教育；

5.限制旅游和高消費。